木瓜锈病病菌在桧柏上越冬，翌年3—4月产生米粒大小红褐色冬孢子堆，遇雨后膨大形成一团褐色胶状物，上面的冬孢子萌发产生担孢子，借风传播到木瓜上进行侵染。后在病斑上又产生锈孢子器，散出的锈孢子随风飘落在桧柏上，侵入后在桧柏上越冬。木瓜锈病以多年生菌丝体在松柏菌瘿中越冬，春雨后产生担孢子，随风雨传播分散。自木瓜树发芽至幼果形成这一个阶段，孢子散落在嫩叶、新梢、幼果上，直接从表皮细胞或气孔侵入，经6～10天的潜育期，在叶片上出现橙黄色病斑，20～25天便形成毛刺状物，从中产生的病菌孢子不再侵染木瓜树，转而侵害转主寄主松柏的嫩叶和新梢，并在松柏上越夏和越冬。病害的轻重与松柏的多寡及距离有关。锈病菌孢子传播有效距离一般为5～10千米，病害与离木瓜园1.5～3.5千米范围内的松柏关系。当木瓜萌芽至幼叶初展时，如一直天气多雨，同时温度对冬孢子萌发适宜，就有利于发病。
