西葫芦病毒病的病原有南瓜花叶病毒、烟草环斑病毒、西瓜花叶病毒、黄瓜花叶病毒以及甜瓜花叶病毒。其中，最主要的病原是黄瓜花叶病毒以及甜瓜花叶病毒。这些病毒的寄主和传播途径都很多，会导致西葫芦病毒病的大面积发生。西葫芦的果腐病多由于生长环境刺激了病菌，导致病菌扩散引起。发病时多集中在茎蒂位置，病菌从此进入果实，最后扩散，导致瓜果软腐，最后完全腐烂。首先要避免西葫芦生长在湿热的环境，这是最容易诱发病菌的环境，发现病瓜后视情况处理，严重的直接摘除，然后浇灌恶霜灵·代森锰锌之类的药剂，从根部滴灌，发病初期也可以用类似的药剂。一周一次，浇灌2-3次即可。
