沤根病主要发生在根尖部分，严重影响植株根部发育，多发生在高温高湿或低温低湿的环境下。在苗床和大田中均可发生沤根。发生沤根后，植株的地上部分生长停滞，长时间不增生新的真叶，已长出的子叶或真叶变黄绿色，边缘逐渐发黄、皱缩，呈枯焦状，最终导致地上部分萎蔫，且容易从土中拔出；严重时成片干枯，似缺素症。拔起受害植株检视，可见其根部不发新根、不定根，或仅长少而细的新根，根皮变黄，原有根系逐渐呈铁锈色腐烂；严重时根皮变为铁锈色并发生腐烂。幼苗、植株地上部分生长停滞，长时间无新叶抽生。已发叶片有黄化趋向，叶缘发黄皱缩，呈焦枯状，严重时植株萎蔫、干枯。发病植株根色由白变黄，不生或少生新根，严重时根呈铁锈色、腐烂，引发死苗。西瓜沤根病易在幼苗期发生，幼苗生长缓慢，叶片萎缩、萎蔫，根部最初成黄锈色，并迟迟不发新根，变黏腐烂，至幼苗上部萎蔫死亡。这种病主要是土壤湿度过大，土壤温度低造成。在土壤低温高湿的条件下，根发育受阻，根部的再生能力、吸收功能、呼吸作用受到严重抑制，根毛大批死亡，而使地上部分萎蔫。育苗时候尽量用育苗碗或者营养钵育苗，主要湿度，水不要较大。西瓜沤根主要是土壤含水量过多，缺氧引起阻碍根尖生长发育，抑制地上部芽叶生长。
