低温、阴雨、光照不足是诱发立枯病的重要条件，其中以低温影响最大。在低温条件下幼苗抗病能力降低，有利于病害发生。气温过低，对病原菌发育和侵染影响小，但对幼苗生长不利，根系发育不良，吸收营养能力下降，更有助于病害发展。如天气持续低温或阴雨后暴晴，土壤水分不足，幼苗生理失调，病害发生加重。
水稻立枯病的发病原因主要有三个：气候条件、侵染循环和种苗素质。水稻立枯病属于土传病害，由多种病原菌侵染而引起，主要有半知菌亚门瘤座菌目和鞭毛菌亚门霜霉目等真菌。丝核菌和镰刀菌等水稻立枯病病源菌广泛存在于土壤中，均为弱寄生菌，一般能在水中或土壤内营腐生生活。因此，秧苗素质差、生长弱、抗病抗逆力差是发生立枯病的直接原因。
水稻立枯病的症状包括芽腐、针腐、黄枯和青枯。芽腐发生在出苗前或刚出土时，幼苗的幼芽或幼根变褐色，病芽扭曲、腐烂而死。针腐多发生于幼苗立针期到2叶期，病苗心叶枯黄，叶片不展开，基部变褐。黄枯、青枯多发生于幼苗2.5叶期前后，病苗叶尖不吐水，叶色枯黄、萎蔫，成穴状迅速向外扩展。在天气骤晴时，幼苗迅速表现青枯，心叶及上部叶片“打绺”。在插秧后本田出现成片青绿枯死。