水分和养分不足，根系受损或高温所致，或肥料供给不平衡所致。结的瓜多，营养跟不上空心；缺水、虫害、不恰当地施肥农药，或大幅度升降温天气环境，由于地温过低或过高而引起的根系受害，从而导致了黄瓜植株水分、养分比例失调；储存时间过长或阳光暴晒失水。三项均可造成瓜瓤干瘪瘦小、空泡少汁，风味欠佳，口味苦涩，不宜生食，但是如果是农残造成的空心黄瓜，则应禁食。
黄瓜植株衰老，根系组织受伤，营养物质无法均衡分配，容易形成空心瓜。雌花授粉不完全，受精后干物质合成量少，营养物质分配不均匀容易形成空心瓜。黄瓜缺硼、缺钾，容易形成空心瓜。高温干燥期黄瓜的长势弱，会形成空心瓜。不恰当的施肥农药，导致黄瓜植株水分、养分比例失调，造成空心黄瓜。黄瓜生长过程中处于高温干旱或者低温高湿的逆境环境，此外水分管理不适宜也会造成空心瓜。