长期使用化肥、除草剂和农药导致农业面源污染，主要原因是为了追求产量而过度施用化肥农药，连续多年对土壤的透支性利用导致土壤质量下降。土壤质量下降的主要表现是有机质含量下降、耕层变浅和土壤养分不平衡。具体原因包括：忽视施用农家肥、种植单一、冬闲抛荒、过度使用除草剂和农药导致微生物减少。掠夺式生产使有机质含量下降，人工化学合成的投入物增加。化学肥料施用年年增量，过量使用化学除草剂，以及缺乏有机肥料的使用，进一步加剧了土壤质量下降。忽视施用有机肥、过度依赖化肥农药和掠夺式生产是主要原因。为了提高土壤质量，增强地力，有必要实施有序休耕。
