在推广种植优良感病品种时，要选择3年以上轮作的田块，避免在马铃薯晚疫病的常发区种植。严禁与番茄连作，避免与茄科类、十字花科类作物连作或套种。
选用无病种薯减少初侵染源。在秋收入窖、冬藏查窖、出窖、切块、春化等过程中，严格剔除病薯，有条件的要建立无病留种地，进行无病留种。
加强栽培管理，适期早播，选土质疏松、排水良好的田块栽植，降低田间湿度，促进植株健壮生长，增强抗病力。轮作换茬防止连作，防止与茄科作物连作。
首先，选用抗病品种。其次，根据当地栽培形式，适当调整播种期，避开晚疫病发生期。如北方一季作区适当早播，建议选用早熟品种，在8月晚疫病流行期前形成产量，可避免一定的损失；同时，栽培时可加厚栽培土层，以降低薯块感染晚疫病病菌的比例。
药剂可用70％代森锰锌可湿性粉剂，每667平方米用量为175～225克，对水后进行喷施。当田里发现有病株出现，建议选用85％瑞毒霉800～1000倍液进行叶面喷施，可根据病情连续防治2～3次，每次间隔7～10天。