谷子黑穗病主要为害穗部,通常一穗上只有少数籽粒受害。抽穗前不易发现,较难识别。病穗刚抽出时,因孢子堆外有子房壁及颖片掩盖不易发现。病穗短,直立,大部分或全部子房被冬孢子取代。当孢子堆成熟后全部变黑才显症。病粒较健粒略大或相等。颖片破裂、子房壁膜破裂后散出黑粉,即病原菌冬孢子。在较低的温度下,谷子萌发与出苗缓慢,拉长了病原菌侵染的时间,发病就较重。土壤含水量在30%—50%适于病菌侵染,土壤干旱或水分饱和都不利于病原菌侵染。种子带菌率高,土壤温度低,墒情差,覆土厚,幼芽滞留土壤中的时间延长,则发病加重。谷子品种间抗病性有明显差异。病害防治主要做好田间管理及肥水管理。