番茄斑枯病病菌在病残体或种子上越冬，也可在多年生茄科杂草上越冬。翌年产生的分生孢子是病害的初侵染来源。病菌通过风、雨、昆虫等传播，从植株气孔侵入为害。低温潮湿环境有利于发病，当温度在15摄氏度以上时，遇阴雨天气、土壤缺肥、植株生长衰弱，病害迅速蔓延。高温干燥时病害较轻。该病主要通过蓟马传毒引起，汁液可接种，种子也能传染。田间管理差、农事操作及病健株相互摩擦易引发此病。病菌分生孢子借风、雨水及农事操作传播到寄主，从寄主表皮萌发后经气孔侵入，菌丝在细胞间蔓延，以分枝的吸器穿入寄主细胞内吸取养分。病毒流行水平主要依赖于虫口密度，最主要的介体昆虫蓟马的成虫藏在土壤中，春季土壤温度上升后，害虫会迁移到杂草上。
