玉米粗缩病在整个生育期都可能发生，尤其以苗期受害最为严重。病株在5至6片叶时开始显现症状，首先在心叶基部及中脉两侧出现透明的油浸状褪绿虚线条点，随后逐渐扩展至整个叶片。病苗叶片浓绿、僵直、宽短而厚，心叶无法正常展开，导致植株生长迟缓、矮化。叶片背部叶脉上会出现蜡白色隆起条纹，触摸时有明显的粗糙感。随着病情发展，植株叶片变得更加宽短僵直，叶色浓绿，节间粗短，顶叶簇生状如君子兰。叶背、叶鞘及苞叶的叶脉上会出现粗细不一的蜡白色条状突起，进一步加重粗糙感。至9至10叶期，病株矮化现象更为明显，上部节间短缩粗肿，顶部叶片簇生，病株高度通常不及健株的一半，多数无法抽穗健壮。个别雄穗虽能抽出，但分枝极少，缺乏花粉。果穗畸形，花丝稀少，植株严重矮化，雄穗退化，雌穗变形，严重时无法结实。
