甜瓜成株发病初期，植株白天萎蔫，早晚可恢复正常，但持续数天后，萎蔫加重，最终全株枯死。植株茎蔓基部缢缩，有的病部出现褐色病斑或琥珀色胶状物。典型症状是当产生枯萎病时，剖视维管束，可看到明显褐变。在潮湿情况下，病部产生白色或粉红色霉状物。发病初期，植株叶片从基部向顶端逐渐萎蔫，中午明显，开始早晚可以恢复，几天后植株全部叶片萎蔫下垂，不再恢复；茎蔓基部稍缢缩，表皮粗糙，常有纵裂；潮湿时根茎部呈水渍状腐烂，表面常产生白色或粉红色霉状物。病株根变褐色，易拔起，皮层与木质部易剥离，维管束变褐色。发病高峰期在植株开花至坐果期。
