黄瓜畸形主要是授粉受精不完全，幼瓜发育受阻所至。授粉受精不完全有天气的原因如低温阴雨和高温干旱，也有黄瓜植株本身的原因如植株缺硼，花粉活力下降，花粉萌发力弱。在黄瓜花蕾期叶面喷洒天然芸苔素加硼砂，有利于提高花粉质量，促进授粉受精，减少畸形瓜发生。
产生畸形瓜有三种情况，一是温度过高或过低、光照条件恶劣、肥水供应不及时，引起植株生长势偏弱，致使开花前12天左右，花内子房就已严重畸形，这样的花开放后，多弱小，向上举，果实膨大后势必相应畸形。二是正常开放的雌花遇到肥料供应不平衡如缺钾、缺硼等，造成瓜条各部位膨大不匀称。三是瓜膨大时，吸收水分过多，也易形成大肚瓜。
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