环腐病菌在种薯中越冬，成为翌年初侵染来源。病菌也可以在盛放种薯的容器上长期成活，成为薯块感染的一个来源。病菌主要靠切刀传播，据试验切一刀病薯可传染24~28个健薯。经伤口侵入，不能从气孔、皮孔、水孔侵入，受到损伤的健薯只有在维管束部分接触到病菌才能感染。病薯播种后，病菌在块茎组织内繁殖到一定的数量后，部分芽眼腐烂不能发芽。出土的病芽中，病菌沿维管束上下扩展，引起地上部植株发病。马铃薯生长后期，病菌可沿茎部维管束经由匍匐茎侵入新生的块茎，感病块茎作种薯时又成为下一季或下一年的侵染来源。环腐病主要由种薯、切块时和收获块茎拉伤传播。
