小麦纹枯病的病原是禾谷丝核菌等，菌核是最重要的初侵染源。识别方法包括：1）烂芽：小麦芽鞘受害变褐色，幼芽阶段导致作物枯死。2）病苗：3-4叶期，第一叶鞘上呈现中央灰白色、边缘褐色的病斑。3）花秆烂茎：返青拔节后，小麦下部叶鞘产生中部灰白、边缘浅褐色的云纹状病斑，多个病斑连接形成云纹状花秆。条件适宜时，茎秆上出现“眼斑”。湿度大时，病叶鞘内侧及茎秆上可见蛛丝状白色菌丝体和类似油菜籽状的黄褐色菌核。危害包括烂芽、病苗死苗、花秆烂茎、倒伏、枯孕穗和枯白穗，一般造成减产10%-20%，严重时可达50%，个别田块甚至绝收。
