花叶型番茄病在苗期到成株期均可发生，初期病叶呈现浅绿与深绿相间的轻微斑驳或花叶，叶片变形，对产量影响较小。严重时，叶片出现明显花叶，皱缩不平，新叶变细、变长，扭曲畸形，植株矮化，顶部叶片生长停滞，花芽分化能力减弱，导致大量落蕾、落花、落果，果实变小，多呈花脸型，产量显著下降。苗期感病表现为全株症状，成株期染病则仅在新叶或上部叶片出现症状。蕨叶型植株矮小，花叶病毒导致叶绿素分布不均，果实畸形。
花叶型番茄病在苗期到成株期均可发生，初期病叶呈现浅绿与深绿相间的轻微斑驳或花叶，叶片变形，对产量影响较小。严重时，叶片出现明显花叶，皱缩不平，新叶变细、变长，扭曲畸形，植株矮化，顶部叶片生长停滞，花芽分化能力减弱，导致大量落蕾、落花、落果，果实变小，多呈花脸型，产量显著下降。苗期感病表现为全株症状，成株期染病则仅在新叶或上部叶片出现症状。蕨叶型植株矮小，花叶病毒导致叶绿素分布不均，果实畸形。