玉米青枯病的病原菌尚有争论，各地分离的病菌不同，主要有两种看法：一种是由真菌镰刀菌引起的；另一种是由真菌腐霉菌引起的。此外，也有观点认为是由腐霉菌和镰刀菌复合侵染形成的。这三种情况都存在，由于各地生态环境不同，得出的结果不一。镰刀菌和腐霉菌二者都能浸染致病，引起玉米青枯病，只是环境不同，主次不一而已。高温高湿利于发病；均温30℃左右，相对湿度高于70%即可发病；均温34℃，相对湿度80%扩展迅速。地势低洼或排水不良，密度过大，通风不良，施用氮肥过多，伤口多发病重。轮作，高畦栽培，排水良好及氮、磷、钾肥比例适当地块植株健壮，发病率低。
