控制温度。顶土出苗的苗盘以4～6盘的宽度为一组，摆放在铺地膜的地面，各组间留30厘米宽走道，便于管理。幼苗刚出土6天，降低苗盘温度。白天20～25℃，夜间10～12℃，后半夜8～10℃，最低为8℃，有利于根系的生长。6～7天后，一片真叶展开，将气温提高到25～28℃，夜间15～18℃。此期白天的温度逐渐上升，达到25℃时及时通风，尽量通上风口，避免冷风直吹幼苗。如果温度超过35℃，应采取上下通风，下通风口要用塑料薄膜遮挡，避免下部前沿的冷风直吹幼苗。当棚内低于25℃以下，不再升温时，立即关闭通风口，使棚内长时间达到18～25℃的适温，夜间上半夜12～15℃，后半夜8～10℃。
进入冬季后，温室番茄应以保温增温为管理重点，低温容易造成番茄落花落果，甚至出现冻害，坐果率会大幅降低，从而严重影响到产量，因此，一定要科学掌控棚内的温度，一般白天温度保持在23-28℃，晚上15-18℃，以上温度为番茄生长最适温度。如遇到暴雪或大风降温天气，可采用煤炉、暖气或人工补充光照的方法加温。
合理密植，及时灌水追肥、打岔，摘除老叶落蔓，防治病虫害。