芹菜根腐病的防治方法：
1.实行轮作：用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。与非伞型花科和非茄科蔬菜实行轮作，重病田块来年应与豆科、禾本科作物轮作。
2.科学用肥：注意增施生物有机肥和磷钾肥，减少和防止单一使用氮肥。施用充分腐熟的农家肥，同时要加深耕层，增加土壤的透气性。深翻土壤40公分以上，翻地时间不能晚于定植前20天。
3.药剂防治：当病害刚发生时，可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、70%敌克松可湿性粉剂800-1000倍液、98%恶霉灵可湿性粉2000倍、10%双效灵水剂1000倍或25%敌力脱乳油1000倍灌根，每5-10天灌一次，连灌1-3次。使用根腐灵和炭疽灵交替使用，效果更好。
4.田间管理：合理浇水，注意雨后排水；及时防治地下害虫；及早拔除病株，收获后彻底清理病残体，带到田外集中销毁。
加强水肥管理，结合药剂防治，可有效控制芹菜根腐病的发生和蔓延。