玉米茎基腐病先从根部受害，最初病菌在毛根上产生水渍状淡褐色病变，逐渐扩大至次生根，直到整个根系呈褐色腐烂，最后粗细根变成空心。根的皮层易剥离，松脱，须根和根毛减少，整个根部易拔出。逐渐向茎基部扩展蔓延，茎基部1～2节处开始出现水渍状梭形或长椭圆形病斑，随后很快变软下陷，内部空松，一掐即瘪，手感明显。节间变淡褐色，果穗苞叶青干，穗柄柔韧，果穗下垂，不易掰离，穗轴柔软，子粒干瘪，脱粒困难。发病初期，植株的叶片突起，出现青灰色干枯，似霜害;根系和茎基部呈现出水渍状腐烂。进一步发展为叶片逐渐变黄，根和茎基部逐渐变褐色，髓部维管束变色，茎基部中空并软化，致使整株倒伏。发病轻的也使果穗下垂，粒重下降。首先是根系发病，局部产生淡褐色水渍状病斑，逐渐扩展到整个根系，呈褐色腐烂状，最后根变空心，根毛稀少，植株易拔起;病株叶片自上而下呈水渍状，很快变成青灰色枯死，然后逐渐变黄;果穗下垂，穗柄柔韧，不易掰下;籽粒干瘪，无光泽，千粒重下降。玉米炭腐茎基腐病的症状：果穗苍叶青干，子粒干瘪。
