农业机械的深翻效率受多种因素影响。农机设备的类型、性能和状态是关键因素之一。不同类型农业机械的深翻效率各异，先进设备因动力强大、工作效率高，能更快速地完成深翻任务。此外，设备的维护状况也影响其效率，良好的工作状态有利于提高深翻效率。
工作条件也是影响深翻效率的重要因素。平坦无障碍的土地有利于提高农机设备的深翻效率，而崎岖地形或障碍物则可能降低效率。天气状况同样影响深翻效率，例如大暴雨或土地湿润可能导致操作困难，从而影响效率。
人工操作对深翻效率的贡献不容忽视。充足的操作人员、默契的配合以及合理的分工有助于提高农机设备的深翻效率。相反，人员不足或操作不当则会导致效率下降。