收割机作业时产生的杂质是振动筛堵塞的主要原因之一。在农田作物生长过程中，常常会有杂草、杂质等不同程度的混入，而收割机在收割作业时往往无法完全避免这些杂质。当这些杂质进入振动筛的时候，由于形状不规则或者过大，很容易导致振动筛的孔眼堵塞，进而影响振动筛的正常工作。
作物在收割过程中的含水量也是振动筛堵塞的原因之一。在收割机作业时，作物的含水量过高会导致作物的软化和变形，进而增加作物在振动筛上的粘附性，使得杂质更容易黏附在振动筛上，从而导致振动筛的堵塞。
振动筛自身的质量问题也可能导致堵塞。振动筛的质量与筛孔的大小、材质的选择以及制造工艺等相关。如果振动筛的筛孔过小或者材质不合理，会导致作物和杂质无法正常通过筛孔，从而堵塞振动筛。
振动筛的维护和清洁不到位也是振动筛堵塞的原因之一。振动筛在作业过程中容易受到作物和杂质的摩擦和振动的影响，如果振动筛的清洁及时不到位，作物和杂质会在筛孔上积累堆积，进而导致振动筛的堵塞。
