农机事故责任的认定主要由农业主管部门负责。农业主管部门会组织专家对农机事故进行调查和鉴定，确定事故的原因、责任方和损失程度等。他们会采集事故现场的证据，收集事故相关的证言和资料，并根据相关法律法规对责任进行界定。农业主管部门还会对事故中涉及的农机具进行检测和评估，以确定其是否存在质量问题或使用不当等情况。
公安部门在农机事故责任的认定和处理中发挥着重要的作用。公安部门会对事故进行勘查和调查，确定是否存在人为犯罪行为或违法行为。他们会对事故现场进行勘察，收集相关的证据和资料，并依法对涉案人员进行讯问和调查。公安部门还会对事故责任方进行处罚和追责，维护社会秩序和公共安全。
司法机构在农机事故责任的认定和处理中起着裁决作用。一旦发生农机事故纠纷，涉及的各方可以通过法律途径解决争议。他们可以向法院提起诉讼，由法院根据相关法律法规和证据进行审理和判决。司法机构会依法对事故责任方进行赔偿和惩罚，保护受害人的合法权益，维护社会公平和正义。