喂入量是影响联合收割机性能的关键因素。传统型联合收割机在超负荷时会出现滚筒堵塞现象，操作者可通过声音及时发现并调整。然而，轴流式联合收割机的秸秆破碎程度较高，清选系统往往先于脱粒部分超负荷，导致跑粮等故障。因此，操作者应更加关注喂入量。
脱粒滚筒与凹板的间隙对谷物脱粒效率至关重要。分离滚筒的脱粒能力固定，因此只要最终能脱净，应尽量减少脱粒滚筒的脱粒程度。这是轴流式联合收割机的重要使用原则之一，以避免秸秆过于破碎和清选系统超负荷。在收割过程中，随着作物成熟度和干燥程度的变化，滚筒与凹板的间隙也应相应调整。
风量的大小直接影响清选效果。风量应尽可能大，以吹出轻质物料，留下籽粒。调整风向和风量，使筛子前半部分的气流稍大，可以提高清选效率。适当的风向调整还能确保筛子上方气流均匀分布，提高整体清选效果。
最后，调整相关部位以减少杂余总量也至关重要。通过增大风量、调整风向和尾筛开度，可以减少秸秆和籽粒进入杂余系统。合理调整杂余延长板的位置，确保物料顺利排出，有助于保持杂余量较小，提高整机作业效率，并避免杂余输送系统损坏。