柴油机是农机具重要的动力输出设备，正确使用和保养，才能产生更好的经济效益。无论是新的还是大修后的柴油机，都必须按规定进行磨合后方能投入正常作业。
柴油机使用过程中需要保持油净、水净、气净和机车净。柴油不净会使精密偶件磨损，机油不净会使轴颈和轴瓦间产生磨料磨损，冷却水不净会使水箱增加水垢，影响发动机散热，机车外表不净会使机体表面受到腐蚀，影响寿命。
此外，需要经常检查紧固零件，特别是连杆、缸盖和飞轮壳等处的连接螺栓。柴油机的气门间隙、配气相位、减压间隙、供油提前角和喷油压力等应及时检查、调整，以保证发动机处于良好的技术状态。