脱粒机使用完毕后，应立即进行封存处理。封存时应做好以下工作：将机器内外的灰尘、污垢；茎秆、颖壳等杂物清理干净。将传动塔轮、脱粒机滚筒等未涂漆的金属零件表面涂上防锈油。
对于机架、罩盖等磨去漆皮的部位补刷油漆。卸下电机、传动皮带等附件，并连同其他附件一起妥善保管。将机器放置在干燥的库房或场棚，有条件时最好用道木垫起，并盖打油布，以防止机器受潮、暴晒和被雨淋。
来年使用前，应对脱粒机进行一次全面的彻底清扫和检查修理，应打开所有轴承座盖，清除油污和杂物，重新上足润滑，并更换修整变形、磨损的零件。更换滚筒纹杆时，应注意按重量分组，按照重量加平衡垫进行安装，以保持滚筒平衡。更换个别纹杆时，不但要注意平衡，而且还要通过适当调整垫片厚度来使滚筒在最小的径向跳动下运转。零件更换、修理后，各连接螺栓都必须按要求紧固牢靠。