脱粒季节结束后，应立即对脱粒机进行封存。首先，清理机器内外的尘土、污垢、茎秆、颖壳等杂物。其次，对未涂漆的金属零件，如传动皮带轮、脱粒机滚筒等，涂上防锈油，并对机架、罩盖等磨去漆皮的地方进行补刷油漆。接着，卸下电机、传动皮带等附件，并妥善保管。将机器放置在干燥的库房或厂棚，最好用枕木垫起，并盖上油布，以防机器受潮、曝晒和雨淋。
在次年使用前，应对脱粒机进行全面清扫和检修，打开全部轴承座盖，清除油污和杂物，重新上足润滑油，并更换修整变形、磨损的零件。更换滚筒纹杆时，应注意按重量分组，根据重量加平衡垫进行安装，以保持滚筒平衡。更换个别纹杆时，要注意平衡，并通过适当调整垫片厚度使滚筒在最小的径向跳动下运转。零件更换、修理后，确保各连接螺栓按要求紧固牢靠。