为了使微耕机保持最佳性能，新购微耕机必须进行磨合，使用中的微耕机必须进行定期保养与维护。
磨合：新购的微耕机开始使用时是磨合阶段，油门不能开得太大，发动机必须中速运行（用1挡耕作）。在运转20小时后，趁热机状态卸下发动机曲轴箱的放油螺塞，放出机油，然后再将螺塞拧紧，从注油口加入足量的新机油，同时也要更换传动箱的齿轮油。传动箱受到磨损，会导致发动机启动困难，油耗增加，马力下降，严重时造成机器损坏。
保养：
1、每天保养。检查燃油箱的燃油、发动机的机油和传动箱的齿轮油，若是水冷式发动机，还要检查水箱中的冷却水。检查并调整皮带松紧度。清除表面油污、泥土及杂草等。检查并紧固各部连接螺栓及轴销。
2、发动机工作100小时的保养。更换发动机机油；清除汽油机火花塞电极积炭，调整火花塞间隙至0.7－0.8毫米；检查并调整气门间隙（需在冷机状态时进行调整），汽油机进气门间隙0.10－0.15毫米，排气门间隙0.15－0.20毫米；柴油机进气门间隙0.15－0.25毫米，排气门间隙0.25－0.35毫米。清洗燃油滤清器滤芯和空气滤清器滤芯。
3、发动机工作500小时的保养。检查气门的严密性；检查连杆瓦间隙；清除活塞表面积炭，必要时更换活塞环；更换磨损的耕刀。
