棉花立枯病最典型的症状是棉花株体上枯萎和死亡。一般来说，感染立枯病的棉花，其生长状况会明显萎缩，株体逐渐变黄，叶片变干。当病情恶化，病株会快速死亡，甚至在短时间内全部枯萎。在这个过程中，病株不仅无法形成棉铃和种子，而且还会导致周围的棉花遭到感染，使得整个棉田的产量大幅下降。
另外，棉花立枯病还有一些其他的症状。例如，病叶常常会呈现出不规则的干枯斑点，这些斑点的边缘会呈现暗色的环形。同时，感染病株的叶子也会变得松弱，并且叶脉也会出现异常。此外，病株的根系也会由于病菌的入侵而变得腐烂，从而无法吸收足够的水分和养分。