一、病害防治
1.炭疽病：幼苗期易受炭疽病的侵袭，应采取药浴法或药浇法进行防治。使用40%的多菌灵可有效预防炭疽病，每10天喷一次，喷药前要将龙眼树冠喷湿。
2.根腐病：幼苗期的龙眼易受根腐病的危害，为预防该病害的发生，可以在幼苗期给予对根系生长有利的生物肥料或菌剂，如菌核生物肥、液体菌根剂等。
二、虫害防治
1.龙头象甲：龙头象甲是龙眼幼苗期的主要害虫，成虫会在幼苗的嫩枝上产卵，卵孵化后的幼虫会钻入树干内部，导致枝条枯死。应采取钻孔注药法或喷洒气雾剂进行防治，使用氧化乐果或氯氰菊酯等杀虫剂即可。
2.叶介壳虫：叶介壳虫会在树干或幼嫩枝条上寄生，使得龙眼幼苗的叶片枯黄、凋萎，严重者会导致整株死亡。应采取喷洒杀虫剂进行防治，使用久效性杀虫剂如敌敌畏、敌百虫等，每个月喷药一次即可。