1.加强土壤管理
由于辣椒根腐病主要发生在土壤中，因此加强土壤管理是防控的重点。首先，要注意土壤排水，保持适宜的湿度，避免水涝。其次，要控制土壤pH值，维持在6.0~7.0之间，这有利于减缓病菌的繁殖。还要注意施肥，科学配比，避免过量施肥。
2.选择抗病品种
对于辣椒根腐病，选择抗病品种是一个重要的防控措施。在品种选择上，要选择具有抗病性的品种，降低病害发生的可能性。同时，还要注意种子消毒，避免带入病原体，从源头上防控病害。
3.采用化学防治
化学防治是一种有效的防控手段，但是需要注意使用方法。首先，要选择适宜的农药，根据病情选择合适的药剂。其次，要注意药剂的浓度和使用方法，避免过量使用，避免对环境产生污染。另外，要按照农药说明进行使用，避免对人体健康产生危害。
4.加强病害监测
及时发现和处理病害是防控辣椒根腐病的重要一环，因此要加强病害监测。定期巡查和观察植株生长情况，发现异常情况及时处理。此外，还可以通过检测土壤和植物组织来判断病情，从而制定相应的防控措施。