1. 叶片受损
大豆叶片是大豆斑枯病的主要受害部位。在发病初期，叶片会出现随机分布的小型白色斑点，随着病情加重，斑点逐渐扩大，变成大小不一的圆形或不规则的斑块。叶片表面的病斑呈圆形或不规则的形状，边缘清晰，中心呈浅黄色或浅褐色。随着病情加重，病斑逐渐融合，导致叶片上出现大面积枯死斑块，最终导致叶片枯死。
2. 茎秆受损
除了叶片，大豆斑枯病还会对茎秆造成极大的危害。病菌进入茎秆后，会在茎秆内部产生菌丝和分生孢子，导致茎秆内部腐烂和溃烂。茎秆受损后，会导致植株失去支撑力，易发生倒伏和折断等现象，严重影响大豆的生长和发育。
3. 荚果受损
大豆斑枯病还会对荚果造成危害。感染后的荚果表面出现黑色斑点，茎部开始腐烂、变黑，荚果变得干瘪、不成形，病果数增多，种子发芽率下降，严重影响大豆的产量和质量。