割除父本可以避免同源杂交。如果不割除父本，就有可能导致自交杂交，这会影响到制种田的效果。而割除父本则能够确保每一株杂交水稻都是真正的杂交种，提高了种子的质量和产量。
割除父本也有助于控制害虫和病害。父本植株可能会成为害虫和病菌的滋生源，如果不及时割除，就会给杂交水稻的生长带来隐患。割除父本可以有效地控制这些问题，减少病虫害对水稻的影响，提高生长效率。
割除父本还有助于节约资源和提高效率。父本植株的存在会占据土地和养分，影响杂交水稻的生长。而割除父本可以释放出更多的土地和养分，为杂交水稻的生长提供更好的环境和条件，提高了生长效率和产量。