连作障碍与土壤病原体有关。同一土壤中如果连续种植同一种蔬菜，则会导致土壤中的病原体大量繁殖，从而影响蔬菜生长发育。例如，连续种植茄子会导致土壤中的病原体增加，从而引起茄子根部腐烂等症状。
连作障碍与土壤营养素有关。同一土壤中连续种植同一种蔬菜，会导致土壤中的营养素不足，从而影响蔬菜的生长发育。例如，连续种植油菜会导致土壤中的氮素和磷素减少，从而影响油菜的生长和产量。
连作障碍与土壤微生物有关。同一土壤中连续种植同一种蔬菜，会导致土壤中的微生物种群发生变化，从而影响蔬菜的生长发育。例如，连续种植辣椒会导致土壤中的放线菌和链霉菌数量增加，从而引起辣椒大量凋萎和死亡。
