机插秧和常规栽插水稻在施肥方式上不同。机插秧主要采用了精细施肥技术，即根据土壤肥力、作物需求以及地形地貌等条件，对每个作业单元进行科学施肥。而常规栽插水稻主要是采用整地施肥、均匀撒布的方式进行施肥，对于不同的土壤和不同的需求往往不能做到灵活应变。
机插秧和常规栽插水稻在施肥效果上也有很大的区别。机插秧采用了精细施肥技术，可以根据不同的土壤和栽培方式进行施肥，保证了作物的吸收利用率，提高了产量和品质。而常规栽插水稻由于施肥方式的限制，常常出现了肥料过多或者过少的情况，不同程度地影响了产量和品质。
机插秧和常规栽插水稻的施肥成本也不同。由于机插秧采用了精细施肥技术，需要进行更多的土壤调查、施肥计算等工作，所以其施肥成本相对较高。而常规栽插水稻的施肥成本相对较低，但是由于施肥效果不佳，还产生了不必要的浪费。
