导致包衣质量下降。当水稻种子包衣时，需要将种子和包衣混合在一起，然后加入其它材料进行混合和包覆。如果温度过低，混合和包覆的过程就会变得困难，因为低温会影响到包衣材料的流动性，从而导致包衣质量下降。
影响种子的萌发率。水稻种子包衣的主要目的是保护种子，并增强种子的抗逆性。然而，如果在包衣的过程中，温度过低，就会导致种子内部发生冷害，从而影响种子的萌发率。这是因为低温会破坏种子内部的细胞结构，从而影响种子的能量代谢和生长发育。
影响种子的品质。水稻种子的品质受到包衣过程中温度的影响。如果温度过低，就会导致种子中的水分凝固成冰，从而破坏种子的细胞结构，影响种子的品质。此外，低温还会引起种子中的氧化反应，从而影响种子的品质和储存期。
