一、叶片受害
柑橘绿霉病初期在叶片上形成小点，逐渐扩大，形成圆形或不规则形斑点，呈黄白色，边缘不规则，中央轻微凹陷，表面粗糙。随着病情发展，叶片愈来愈多的被病原体覆盖，叶片颜色发生变化，从黄色到褐色，甚至出现黑色病斑。这些病斑会严重影响光合作用，造成叶片萎缩，甚至脱落，导致柑橘树的生长发育受到限制。
二、果实受害
柑橘绿霉病会使果皮表面出现灰白色霉层，霉层上有黑色小点，最终形成黑色菌核，对果实外观产生不良影响。同时，果实内部也受到病害的影响，病斑处果肉发生变软、腐烂，质地变得粘稠，极易感染其他病菌，从而引发更多的果实腐烂，导致大量的果实损失。
三、树皮受害
柑橘绿霉病也会侵害柑橘树的树皮，使其表面形成灰白色霉层，导致树皮失去光泽，愈合困难。一旦病害进一步发展，树皮可能会开裂，从而进一步引发植株的死亡。
