在多雨季节，防治水害是田间管理的重点之一。由于多雨时期土壤含水量增多，容易导致灌溉和排水不畅，甚至造成水浸根系、泥淹叶片等现象。因此，农民应该及时排水、防止积水，清洁沟渠，避免水淤积，同时还应注意及时疏通沟渠。
保持土壤透气性也是多雨季节进行田间管理的重点。土壤的透气性很重要，它可以增强土壤的通气性和水分渗透性，有利于植株的健康生长。当土壤过于湿润时，会使土壤的透气性下降，阻碍植株的正常呼吸，影响辣椒的生长。因此，应该合理地施用有机肥，增加土壤的有机质含量，提高土壤的透气性。
多雨季节要加强病虫害防治。由于多雨时期容易出现病虫害，如病菌、霉菌等，对辣椒的生长产生很大的影响。因此，农民应该及时的采取防治措施，如喷洒农药、增加通风、注意及时清理病叶、果，在防治病虫害的同时，也要注意保护生态环境，避免对农作物和环境造成过度污染。
