水萝卜在生长过程中容易受到真菌、细菌和病毒的侵袭，这些病原体会导致病斑、叶片枯萎、根腐等症状。因此，农民需要在栽培前选择健康的种子，避免病原体传入土壤。此外，合理施肥和浇水，控制土壤湿度和通风，也能减少病害的发生。
水萝卜还容易遭到昆虫的攻击，如蚜虫、叶蝉等。这些昆虫会在叶子和茎上吸食汁液，导致水萝卜生长缓慢、瘦弱、畸形等症状。因此，农民需要及时采取防治措施，如喷洒农药或贴黄板等。
水萝卜的栽培过程中也要注意消毒和防止交叉感染。在收获前，要彻底清理留在田间的残根和残叶，并消毒种植土和工具，以防止病原体在下一季的种植中继续传播。
