利用以农业防治为主的无害化综合治理技术是防治设施蔬菜土传病害最经济、有效且无公害的方法。具体的操作方法为：
在6月-7月上茬作物收获后，清除作物的残体，除尽田间杂草，运出棚外集中深埋或烧毁。将作物秸杆及农作物废弃物，如玉米秸、麦秸、稻秸等利用器械截成3-5cm的寸段，玉米芯、废菇料等粉碎后，以1000-3000kg/亩的用料量均匀地铺撒在棚室内的土壤或栽培基质表面。将鸡粪、猪粪、牛粪等腐熟或半腐熟的有机肥3000-5000kg/亩，均匀铺撒在有机物料表面，也可与作物秸杆充分混合后铺撒。在有机物料的表面均匀的撒施氮磷钾有效含量为15：15：15的三元复合肥30kg/亩，或磷酸二铵15kg/亩和硫酸钾15kg/亩或10kg/亩尿素和40kg/亩过磷酸钙。有机物料速腐剂以6-8kg/亩标准均匀撒施在有机物料表面。深翻25cm-40cm，整地做成利于灌溉的平畦。加施有机物料速腐剂进行高温闷棚操作时，对棚室内土壤或基质进行灌水至充分湿润，相对湿度达到85%左右，地表无明水，用手攥土团不散即可。不添加有机物料速腐剂进行高温闷棚操作时，对棚室内土壤或基质进行大水漫灌至地表见明水，相对湿度达到100%。棚室内部无立柱的，可选用地膜或整块塑料薄膜进行地面覆盖;棚室内有立柱的，可选用地膜或小块塑料薄膜覆盖。搭接严密无漏缝。封闭棚室并检查棚膜，修补破口漏洞，并保持清洁和良好的透光性。密闭后的棚室，保持棚内高温高湿状态25-30天。其中至少有累计15天以上的晴热天气。高温闷棚期间应防止雨水灌入棚室内。闷棚可以持续到下茬作物定植前5-10天。打开通风口，揭去地膜，进行晾棚。待地表干湿合适后，可整地作畦为下茬作物栽培做准备。每年同期进行高温闷棚处理一次，巩固棚室消毒效果。
