1、实行轮作倒茬，及时拔除病株。发生过西瓜枯萎病的田块，最好间隔三年以上再种西瓜。发现病株立即拔掉烧毁，并在病株穴中灌入20%的新鲜石灰乳，每穴灌药液500毫升。
2、选用抗重茬的西瓜品种，也可用葫芦做砧木嫁接西瓜苗。
3、加强栽培管理：瓜地要选地势较高、排水良好、肥沃的沙质壤土地。雨后要注意排水，防止积水成涝。浇水最好沟浇，采用细水渗灌，不要大水漫灌。施足底肥，注意氮、磷、钾肥配合施用防止偏施氮肥，特别是结瓜期更要控制氮肥的用量，以引起蔓叶徒长，诱发枯萎病。
4、药剂防治：用2.5%适乐时悬浮剂200倍液，或30%甲霜恶霉灵600倍液，每株灌药液0.4-0.5公斤。座果初期喷洒10%双效灵水剂200倍液，或高科30%甲霜恶霉灵600倍液，或38%恶霜嘧铜菌酯800倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂800-1000倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液加15%粉锈宁可湿性粉剂4000倍液，或用70%甲基托布津1000倍液或40%瓜枯宁1000倍液喷雾。每隔10天喷1次，连喷2-3次，亩喷60公斤，于晴天下午进行。
