合理的设计，可以节约材料、省工省时，是确保修建沼气池成功的关键。设计沼气池的主要原则如下：
1.技术先进，经济耐用，结构合理，便于推广。
2.在满足发酵工艺要求，有利于产气的情况下，兼顾肥料、卫生和管理等方面的要求，充分发挥沼气池的综合效益。
3.因地制宜，就地取材，力求沼气池池形标准化、用材规范化、施工规范化。
4.考虑农村修建沼气池面广量大，各地气候、水文地质情况不一，既要考虑通用性，又要照顾区域性。
总之，沼气池的设计关键就是要使设计出来的沼气池有利于进出料、有利于沼气池的管理、有利于提高产气率和提高池温为原则。根据实践经验证明：沼气池的结构要“圆”（圆形池）、“小”（容积小）、“浅”（池子深度浅）；沼气池的布局，南方多采用“三结合”（厕所、猪圈、沼气池），北方多采取“四位一体”（厕所、猪圈、沼气池、太阳能温棚）。
