一、使用鸡粪有机化肥种植小麦，使其完全腐熟以后，可以使用。若没有进行完全腐熟可能会对作物造成伤害：
伤害1：如果使用前没完全腐熟，使用后鸡粪将在土壤中进行腐熟，此时会产生热量，对作物根系造成伤害。
伤害2：没有完全腐熟的鸡粪会将病菌、寄生虫等带入土壤，提高了病虫害的发生几率，埋下了隐患。完全腐熟的标志：鸡粪没有臭味就证明完全腐熟了。
二、生物有机无机复合肥，一般可作基肥、追肥。看情况可当作复合肥施用。每亩30—75公斤。
三、如果是单纯微生物肥料，一般用量少，每亩用量1—4斤，可作拌种、叶面喷施、淋施等。如固氮菌剂，花生根瘤菌，生物钾肥。
四、纯生物肥料一般不与杀菌剂混合用，不与碳铵、过磷酸钙、含硫复合肥混合或同时施用，应隔层土，再施入菌剂。
考虑到小麦的产量是有限的，所以不必像一些无限生长型的蔬菜那样每亩地用十几方甚至几十方有机肥。如果是用鸡粪的话每亩地用个三到五方就可以了，成本也就在三四百元左右而且对下茬作物也有效。如果用成品有机肥的话一亩地用三四百斤就可以，成本差不多的。
