种子消毒。芹菜斑枯病病菌的致死温度为49℃左右，播种前用热水浸种30分钟可杀死部分病菌，浸种时要不断搅动。
平衡施肥。基施充分腐熟的有机肥，生长期增施磷钾肥，控制氮肥用量，并及时喷施叶面肥和微肥，增强植株抗逆能力。
降温排湿。白天棚温控制在15～20℃，超过20℃及时通风，夜间控制在10～15℃，缩小昼夜温差，减少结露。不能大水漫灌。
及时清除保护地内的病残体，减少菌源。
药剂防治。在芹菜苗高3厘米时开始喷药保护，适用药有70%代森锰锌可湿性粉剂、58%甲霜？锰锌可湿性粉剂、杀毒矾64%霉？锰锌可湿性粉剂、75%百菌清可湿性粉剂、50%多菌灵可湿性粉剂等，每隔7～10天一次，连续防治2～3次。发病期及早施药防治，尽量避免喷雾施药，可以每亩用45%百菌清烟剂200～250克熏烟，或者每亩用5%百菌清粉剂1000克喷粉，以降低棚内湿度。
