生虫的小麦要及时处理。夏秋季节小麦生虫可采用日光暴晒的办法，使粮温升到46℃以上，翻晒2小时后拢堆，直接高温人库闷仓，利用粮堆内的高温杀死害虫。对于麦蛾，还可采用压盖密封的方法防治，即在粮面上先铺一层苇席，再用干燥无虫的稻糠、草木灰、蚕豆或河沙等密实压盖，厚度约10一20厘米，使麦蛾无法钻出粮面交尾产卵而死亡。对于玉米象等害虫，可采用过风车、过筛的方法除虫。
对于生虫比较严重的小麦，可以使用化学药剂熏蒸杀虫的方法进行处理。目前国内外普遍使用的药剂是磷化铝片剂或粉剂。农户应使用密封小包装专用剂型。磷化铝的杀虫作用主要是磷化铝与空气接触时，与空气中的水分产生反应，释放出磷化氢剧毒气体，而杀死害虫。为保证杀虫效果和防止毒气泄漏危及人员安全，磷化铝的使用必须要求被熏蒸的小麦能够严格密闭。如使用气密粮囤或用塑料薄膜严格密封，否则不能采用化学药剂熏蒸杀虫。
使用磷化铝的用药量一般按每立方米小麦用56%的磷化铝片剂1一2克进行计算。施药前，应密闭粮仓(囤)，粮仓所有接口部位、缝隙、出粮口等均应使用塑料胶带密封，只留下上部作为投药口。投药时，将磷化铝每一小包装用针刺孔3一5个，迅速埋人麦堆，然后立即封好投药口，使粮仓处于密封状态。对于上部开口的缸、水泥池等装具可用0.18—0.2毫米厚的聚氯乙烯薄膜将顶部封好。施药后，粮仓密闭时间不得少于15天。熏蒸结束后，打开粮仓，通风散气2天后方可加工食用小麦。熏蒸期间要勤开门窗，保持室内空气流通。人员不得在该房间长时间停留，更不能住人。若小麦不急于使用，可长期密闭贮藏，以防外界害虫感染。
