1、沤肥法：这是一种厌氧发酵处理法。采用就地开挖沤肥池，一般挖长约2米、宽1.5-2米、深0.5-1.5米的方土坑，如果是永久性的，可修建水泥池。春茬蔬菜收获后，除去具有商品性、食用性以外的剩余部分，作为废弃物集中收集，菜叶和土按3：1的比例分层填入池内。
具体做法是：在池底垫入30厘米的熟化土壤，先将蔬菜废弃物填入50厘米，洒入适量碳酸氢铵（每立方米池用量5公斤），加20-30厘米土均匀覆盖，再将蔬菜废弃物填入50厘米，上面均匀盖土，直至堆满为止，然后踏实，尤其要踏实边缘，同时为了加快发酵速度，达到完全分解，每填入一层，用500倍EM有效微生物稀释喷撒蔬菜废弃物，最后在表面多喷些EM有效微生物稀释液，然后用塑料膜包严发酵。通过一段时间高温堆闷腐熟，熟化后成为很好的有机肥。在此过程中关键步骤在于池内腐化物的升温，这样才能达到肥效好，有害生物也能被杀灭的效果。
3、直接还田法：秋茬蔬菜收获后，将废弃物均匀散于地面（清除不分解的绳子和塑料制品），并洒施秸秆发酵菌肥，或洒施碳酸氢铵（每亩用量50公斤）或喷洒EM有效微生物稀释液，再用微型旋耕机结合深耕翻地埋入（无旋耕机要先切断菜叶），最后并压实耙平整。若有灌水条件的，灌透耕层，有利于腐熟分解。前两种方法处理后的有机肥一般作基肥施用，每亩用量为3方可代替农家肥施用（肥效相当）。为降低废弃物所携带病虫害的滋生和传播，可用适量的杀菌剂和杀虫剂处理沤（堆）肥，秋季或来年再结合翻地施入田地。三种方法其工艺简单、成本低廉，可以极大地解决蔬菜废弃物污染环境和资源化利用的问题，可供广泛推广应用。
经化验测定，蔬菜废弃物含钾高，在使用中可减少和不施用钾肥。经过菜叶还田二年以上的土壤有机质提升，土壤通透性好，土壤肥沃。另外在生产实践中，在施用废弃物还田之外，还需配合施用一定量的氮、磷等无机化肥，以便更好地发挥肥效。