在沼气发酵中加入足够量的微生物作为接种物，对产气的快慢和多少有着直接的影响，用微生物肥作接种物优于其它接种物，可提高原料的产气率和产气速率。
微生物肥含菌量高，作用快。微生物菌肥在条件适宜时，以惊人的速度在繁殖，从而加速了有机物的分解，产气速率大大提高，用该菌肥作接种物投料后一般3～5天内就可初步产气，7天后可大量产气，比用其它接种物提前10～30天产气。
用微生物菌肥作接种物方便、快捷、省工、成本低。在备好新料后将经过激活的生物菌肥拌入料中即可入池，入池后其它程序都按正常管理。6～10立方米的沼气池，每池的正常投料量只需三十毫升菌肥即可，成本只需20元左右。
在池温低时产气平稳。在常温发酵过程中，沼气发酵与温度密切相关，温度是产气的关键，新料在10～15℃时用微生物肥作接种物产气后，即使池温在5～10℃时，沼气池亦可正常产气。
微生物菌肥的使用办法。微生物菌肥作为接种物在施用时，须将生物菌肥激活。其方法是将30毫升菌液兑0.35～0.5千克水放置在23℃以上的环境中24小时，低于23℃时放置48小时即可拌入发酵原料中入池内发酵，在正常气温下3～5天便可产气。
