农业防治：选用前茬未种植过葱蒜类蔬菜，土壤肥沃的沙壤土种植大葱；施足基肥，适时追肥，增强植株抗病能力；雨季注意排水，发病后控制灌水，以防病情加重；及早防治虫害；前茬蔬菜收获后，及时清园；合理轮作等。
生物防治：利用微生物农药或生化制剂（农用抗生素）防病害。
化学防治：科学合理使用化学农药防治大葱病害。用75%百菌清可湿性粉剂500倍液、58%甲霜灵锰锌500倍液、50%异菌脲可湿性粉剂500倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液喷雾等防治大葱紫斑病；用65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、15%三唑酮可湿性粉剂800～1000倍液、65%代森锰锌1000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液等防治大葱锈病；用15%植病灵乳剂1000倍液、20%病毒A可湿性粉剂500倍液、5%菌毒清水剂500倍液等防治大葱黄萎病；70%乙磷铝锰锌可湿性粉剂600~800倍液、25%甲霜灵霜霉威可湿性粉剂500～1000倍液、50%安克可湿性粉剂2500倍液、72.2%扑霉特700～1000倍液等防治大葱霜霉病。隔7～10天喷1次，连喷3～4次。注意各种药剂轮换使用。
