1、沼气池启动时,初次加入堆沤发酵的原料，原料液面上不产生串珠状的气泡，或者液面上出现一层白色的膜状物，类似于酸菜容器中的膜状物，表明原料是消毒粪或者原料中的酸性过强（可以用PH试纸测试其酸碱度）。排除的方法是抽出全部的原料，用合格的牛粪进行堆沤发酵重新启动，或者将原料抽出1-2立方米，从正常使用的沼气池中抽取等量的沼渣加入，使沼液的酸碱度趋于正常值，逐渐产生沼气。
2、净化器中的压力表指示针上下波动，表明输气管道内有积水，证明输气管道在安装时向集水瓶方向的坡度小于1%或有凹陷现象。排除方法为断开集水瓶和净化器进气口，用口吹或用打气桶排出积水。
3、打开沼气灶的开关，净化器的压力表指示针快速下降，关上开关，压力表指示针缓慢上升，表明导气管堵塞或输气软管扭曲，管道通气不顺畅。排除方法为疏通导气管，理顺管道。
4、沼气以前使用正常，但在使用一段时间后出现压力表上升缓慢或不升，表明出现了沼气池或输气管漏气、发酵原料不足、沼气发酵接种物不足等问题。排除方法为检修沼气池、管道，增添新鲜发酵原料，增加沼气发酵接种物。
5、使用过程中发现压力表上升快，使用时下降也快，或者压力表没有达到最大限，沼液从水压间向外流出，表明沼气池内发酵料液过多或有浮渣，气箱容积变小。排除方法为取出一些料液或浮渣，保证当气体用完后（压力表指针为零），水压间的水位距水压间上口90厘米。
6、压力表有压力，反映气体多，但较长时间点不着，或者沼气灶脉冲器打不着火，但用火柴能引着火，火焰呈蓝色漂浮状，表明发酵原料中产甲烷气体的细菌少，发酵不正常，产生大量废气，气体中的沼气浓度达不到55%--70%。排除方法是从输气管路的总放气阀向外排放气体，增添接种物或换掉大部分料液，调节沼液的酸碱度（若沼气池中沼液的酸度过大，水压间的液面上就会出现一层白色的浮膜），使气体中的沼气浓度达到可燃点。
7、使用过程中平常产气正常，突然不产气，表明出现输气管路上管子断裂、破损或接口因热胀冷缩而松动、脱节、断开，净化器的开关密封处漏气，池子突然出现漏水漏气，用气后未关阀门或关闭不严等问题。排除方法是接通输气管道；更换破损的管道；修复压力表；用气后关紧阀门。
8、使用一段时间后，在正常使用的过程中出现刺激的臭鸡蛋气味，表明净化器中的脱硫剂失效，不发生氧化反应。排除方法是关闭阀门，取出更换新的脱硫剂。若净化器中的脱硫剂使用一段时间后，由黄色变成了黑色，当有空气进入脱硫剂中，脱硫剂会与空气发生还原反应，脱硫剂将散发出大量的热量，有可能将脱硫剂的塑料容器烧毁，所以在日常的管理过程中，不能出现空气大量通过脱硫剂的错误操作。
