1、选择抗病品种。种植抗病西瓜品种是首选措施，如选用西农八号、丰抗八号等品种。
2、嫁接栽培。由于西瓜枯萎病病菌难以侵染葫芦、瓠瓜、南瓜等，以这些作物为砧木进行嫁接换根，这种方法是解决西瓜枯萎病的较好途径。我县已有一部分瓜农选用葫芦为砧木，进行靠接，减轻了枯萎病的发生。
3、水旱轮作。西瓜枯萎病在土壤中可存活10年，但在水中存活期限只有130多天。因此，水旱轮作是预防枯萎病的最佳方法。
4、种子处理。用漂白粉2-4%溶液浸泡30分钟后捞出并清洗干净，可杀死种子表面的枯萎病病菌及炭疽病病菌。
5、慎用育苗土。育苗用的营养土应选用塘土、稻田土或墙土，禁用瓜田或菜园土，农家肥要充分腐熟，不用带有病株残体的农家肥。
