一、病毒病
甜瓜病毒病是由甜瓜病毒寄生引起的病害，症状主要有三种类型，第一种是心叶出现明脉，后发展为花叶或深绿色病斑、畸形，干旱时病叶缩小，瓜蔓失去结果能力。第二种是黄化型，在叶片上初为褪绿黄斑，后转为斑驳花叶，叶变黄、变厚，叶脉突出，叶缘呈锯齿形，株形矮缩，节间短。第三种是坏死型，叶片上产生系统的不规则的坏死褪绿斑点和条斑，严重时植株矮化。
防治方法：1、要选择抗病品种，合理布局种植区域，瓜地最好远离蔬菜作物，不宜与西瓜、西葫芦、南瓜等混种；2、在播种前要进行种子处理，可以用10%磷酸三钠溶液浸种10分钟，再将种子用清水洗净后催芽播种，这样可杀死种子表面的病毒，减少种子带毒；3、加强田间管理。发现病株后及时拔除销毁，打杈、摘顶时应将病株与健株分开进行，在病株上操作后必须用肥皂水洗手，再在健株上操作，避免人为传毒。
二、霜霉病
甜瓜霜霉病是一种甜瓜的真菌性病害，该病害主要针对温室全年种植瓜类，可不断发生。此病一旦发生，通常难以控制，而且流行极快，造成中下部叶干枯，并很快向上发展，损失也大。果实发育期进入雨季病势扩展迅速，减产30%—50%。甜瓜霜霉病主要危害叶片。叶片上产生水渍状小斑点，后扩展成浅褐色病斑，湿度大时叶背面长出灰紫色霉层。成株染病，叶面上产生浅黄色病斑，沿叶脉扩展呈多角形，清晨叶面上有结露或吐水时，病斑呈水浸状，后期病斑变成浅褐色或黄褐色多角形斑。在连续降雨条件下，病斑迅速扩展或融合成大斑块，致叶片上卷或干枯，下部叶片全部干枯，有时仅剩下生长点附近几片绿叶。
防治方法：1、选抗霜霉病的品种，避免与瓜类作物邻作或连作，有条件的可采用避雨栽培法；2、使用72%霜脲锰锌(霜疫必克)可湿性粉剂600倍液，或69%烯酰锰锌可湿性粉剂600倍液，每间隔7天喷药1次，连续用药2—3次，交替用药。
三、细菌性果斑病
细菌性果斑病侵染叶脉，并沿叶脉扩展。叶片上病斑呈圆形至多角形，边缘初呈V字形水渍状，后中间变薄，病斑干枯。病斑背面溢有白色菌脓，干后呈一薄层，且发亮。严重时多个病斑融合成大斑，颜色变深，多呈褐色至黑褐色。果实染病，先在果实朝上的表皮上出现水渍状小斑点，渐变褐色，稍凹陷，后期多龟裂，褐色。初发病时仅局限在果皮上，进入发病中期后，病菌可单独或随同腐生菌向果肉扩展，使果肉呈水渍状腐烂。
防治方法：30%猎菌斑可湿性粉剂300—400倍或农用链霉素5000—10000倍液喷药2—3次，间隔5—7天。